31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0111 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  100 
 
 		 501 aa  956    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  61.48 
 
 		 492 aa  541  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  63.07 
 
 		 487 aa  529  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2247  replication factor A  59.41 
 
 		 486 aa  528  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  61.54 
 
 		 482 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  37.6 
 
 		 373 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  36.29 
 
 		 371 aa  224  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  37.87 
 
 		 484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1917  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  33.52 
 
 		 429 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  29.43 
 
 		 641 aa  140  6e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0039  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.61 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  29.97 
 
 		 642 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  33.15 
 
 		 641 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  32.58 
 
 		 642 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2098  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  30.06 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2941  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  26.09 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0046707  normal  0.642242 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  27.27 
 
 		 651 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0635  hypothetical protein  27.78 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0089  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.69 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.235418 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0206  single-stranded DNA-binding protein  34.71 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.347589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0797  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.25 
 
 		 137 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.12 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0176  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.57 
 
 		 148 aa  53.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3082  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.09 
 
 		 438 aa  50.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.797812  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0669  single-stranded DNA-binding protein  27.68 
 
 		 158 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00307964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1433  replication factor A  21.11 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.140732 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1661  hypothetical protein  26.03 
 
 		 533 aa  47.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000420689  unclonable  0.000000000000250844 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1248  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  27.27 
 
 		 149 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0456  hypothetical protein  27.36 
 
 		 122 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47438  predicted protein  25.77 
 
 		 650 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.53124  normal  0.0322988 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43365  predicted protein  25.77 
 
 		 649 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.895959  normal  0.0131975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>