20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0456 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0456  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  245  1e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0206  single-stranded DNA-binding protein  39.83 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.347589  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0797  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.36 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0176  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.11 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0669  single-stranded DNA-binding protein  29.63 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00307964 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  31.63 
 
 		 651 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  27.36 
 
 		 501 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  26.88 
 
 		 484 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  30.84 
 
 		 371 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  25.83 
 
 		 425 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  25.23 
 
 		 482 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1629  replication factor A  31.58 
 
 		 311 aa  41.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  33.33 
 
 		 641 aa  41.6  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  35.48 
 
 		 642 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  34 
 
 		 373 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  22.86 
 
 		 642 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0505  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  33.87 
 
 		 641 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.96 
 
 		 487 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34.88 
 
 		 492 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>