12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02690 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND02690  damaged DNA binding protein, putative  100 
 
 		 597 aa  1251    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07423  subunit of heterotrimeric Replication Factor (Eurofung)  41.81 
 
 		 603 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000000373971 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81646  DNA replication factor A  35.08 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.272017 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14457  replication protein a large 70 kD subunit  31.86 
 
 		 606 aa  312  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47438  predicted protein  27.53 
 
 		 650 aa  230  5e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.53124  normal  0.0322988 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43365  predicted protein  27.57 
 
 		 649 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.895959  normal  0.0131975 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_51766  predicted protein  27.78 
 
 		 573 aa  211  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0465734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  30.39 
 
 		 484 aa  54.7  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  28.86 
 
 		 651 aa  52  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49277  predicted protein  27.88 
 
 		 553 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1523  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.32 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.792427 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  26.99 
 
 		 373 aa  47.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>