20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0635 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0635  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  843    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1917  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  37.01 
 
 		 429 aa  245  9e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2098  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  35.81 
 
 		 435 aa  243  7e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0039  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.28 
 
 		 426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2941  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  35.57 
 
 		 429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0046707  normal  0.642242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0963  replication factor A  28.43 
 
 		 484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2204  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.94 
 
 		 492 aa  133  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0886  replication factor A  29.01 
 
 		 371 aa  131  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2247  replication factor A  28.88 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0565  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  30.09 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.361245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0111  replication factor A  27.22 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1764  replication factor A  26.79 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0415  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  28.18 
 
 		 487 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0355  replication factor A  25.61 
 
 		 641 aa  89.7  8e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.860851  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1627  replication factor A  25.14 
 
 		 642 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0561  replication factor A  26.79 
 
 		 642 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.270799  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0286  replication factor A  25.88 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.439991  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0345  replication factor A  25.83 
 
 		 651 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234694  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1248  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.73 
 
 		 149 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1488  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  26.71 
 
 		 425 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.284076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>