287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0542 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0542  thioredoxin reductase-like protein  100 
 
 
279 aa  548  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0652846  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.4 
 
 
243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0393  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.63 
 
 
242 aa  251  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.19159  normal  0.171369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0889  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.23 
 
 
248 aa  245  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2481  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  50.76 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.57969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0781  Thioredoxin reductase-like protein  40.79 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2008  thioredoxin reductase  35.85 
 
 
306 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.141519 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4412  Thioredoxin reductase-like protein  29.37 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2193  thioredoxin reductase  38.38 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0538  thioredoxin reductase  35.92 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.677073 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2000  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.76 
 
 
200 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0272  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.2 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.86 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.417007  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1925  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.96 
 
 
561 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0956827  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  39.53 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  37.4 
 
 
340 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.87 
 
 
318 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4165  thioredoxin reductase  43.75 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.571587  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  33.65 
 
 
317 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  40.24 
 
 
327 aa  62.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3787  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.81 
 
 
199 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  33.65 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3111  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.82 
 
 
193 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684125  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  45.68 
 
 
311 aa  62.4  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.78 
 
 
318 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.87 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  39.62 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  36.46 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1748  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 
559 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0568  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.05 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0040  glucose-inhibited division protein A  47.22 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.390106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  37.5 
 
 
327 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  32.62 
 
 
329 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.28 
 
 
318 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  44.74 
 
 
348 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.84 
 
 
407 aa  58.9  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  41.56 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1191  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.54 
 
 
205 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.015621  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0357  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.24 
 
 
185 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.712618  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  42.25 
 
 
321 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.61 
 
 
547 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  37.65 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  39.76 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  39.76 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  38.75 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  38.1 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  40.28 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  36 
 
 
319 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  37.69 
 
 
361 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12241  putative thioredoxin reductase  33.65 
 
 
463 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0425145  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3641  Thioredoxin-disulfide reductase  45.45 
 
 
357 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  31.71 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  34.91 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2076  Thioredoxin-disulfide reductase  34.78 
 
 
350 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.314276  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1704  thioredoxin-disulfide reductase  40.62 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.473306  normal  0.0188738 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.96 
 
 
318 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  30.94 
 
 
325 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.9 
 
 
459 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.84 
 
 
305 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  33.98 
 
 
348 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  41.89 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  37.36 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  35.44 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  43.24 
 
 
308 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0758  thioredoxin reductase  34.88 
 
 
458 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18111  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  31.01 
 
 
460 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  36.17 
 
 
362 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15981  putative thioredoxin reductase  34.88 
 
 
458 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  37.04 
 
 
340 aa  55.8  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  38.38 
 
 
332 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  33.7 
 
 
458 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  35.24 
 
 
330 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  39.02 
 
 
319 aa  55.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  37.04 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  40.26 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  39.47 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  38.96 
 
 
306 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  31.25 
 
 
458 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  40 
 
 
335 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4596  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.13 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114387  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  38.16 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5841  Thioredoxin-disulfide reductase  32.45 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0474919  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1595  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.57 
 
 
345 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  40.85 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  31.11 
 
 
458 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  37.8 
 
 
316 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0323  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.73 
 
 
356 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0634071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  37.36 
 
 
353 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  32.99 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6387  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.82 
 
 
565 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  36.84 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  37.65 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13151  putative thioredoxin reductase  32.18 
 
 
458 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  36.9 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  37.5 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  33.71 
 
 
457 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  40 
 
 
320 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  33.73 
 
 
458 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  38.46 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  41.1 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>