More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2008 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2008  thioredoxin reductase  100 
 
 
306 aa  604  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.141519 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2193  thioredoxin reductase  59.67 
 
 
311 aa  308  8e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4412  Thioredoxin reductase-like protein  61.85 
 
 
319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0538  thioredoxin reductase  57.89 
 
 
323 aa  266  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.677073 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0781  Thioredoxin reductase-like protein  47.44 
 
 
333 aa  240  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2481  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.29 
 
 
245 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.57969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0889  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.2 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0393  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.02 
 
 
242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.19159  normal  0.171369 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.82 
 
 
243 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0542  thioredoxin reductase-like protein  35.21 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0652846  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  36.84 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  34.82 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2000  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
200 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  38.4 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.64 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0558  thioredoxin-disulfide reductase  29.41 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3641  Thioredoxin-disulfide reductase  37.84 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119542  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.11 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2414  thioredoxin reductase  35.78 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3787  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.61 
 
 
199 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.47 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02881  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.64 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3111  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.49 
 
 
193 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684125  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  34.29 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0357  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.81 
 
 
185 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.712618  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.94 
 
 
459 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  34.44 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.74 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.47 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  33.03 
 
 
442 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.16 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  35.96 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0568  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.15 
 
 
192 aa  58.9  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  33.94 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  35.96 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  30.56 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.16 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5841  Thioredoxin-disulfide reductase  25.2 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0474919  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03841  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.89 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.51 
 
 
348 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  37.93 
 
 
318 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.52 
 
 
197 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.417007  normal  0.368998 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  34.58 
 
 
317 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.48 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2499  thioredoxin-disulfide reductase  35.96 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  29.75 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0323  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.19 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0634071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  31.43 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  36.9 
 
 
319 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4421  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.04 
 
 
572 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  28.8 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4219  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.04 
 
 
346 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  34.58 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  30.08 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  32.41 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1190  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.55 
 
 
560 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  unclonable  0.0000120152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  36.78 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  36.14 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  39.74 
 
 
348 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1748  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.93 
 
 
559 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  33.03 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  36.36 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  37.04 
 
 
343 aa  53.5  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  33.03 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  33.03 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0272  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.17 
 
 
256 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  32.56 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35 
 
 
547 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  30 
 
 
409 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  38.1 
 
 
344 aa  53.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  31.19 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  31.25 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1531  Thioredoxin-disulfide reductase  30.3 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.22031  normal  0.0207408 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.73 
 
 
394 aa  52.8  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0182  thioredoxin-disulfide reductase  30.28 
 
 
312 aa  52.8  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.68776  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.64 
 
 
573 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  37.66 
 
 
302 aa  52.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  31.03 
 
 
331 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6126  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.93 
 
 
575 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  36.14 
 
 
361 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  35.8 
 
 
330 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  34.26 
 
 
336 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  37.35 
 
 
310 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4356  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.93 
 
 
568 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1608  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.62 
 
 
554 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.364295  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12241  putative thioredoxin reductase  29.03 
 
 
463 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0425145  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  39.29 
 
 
335 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2076  Thioredoxin-disulfide reductase  32.43 
 
 
350 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.314276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  28.07 
 
 
314 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  36.84 
 
 
318 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  36.9 
 
 
317 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  34.12 
 
 
331 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1269  thioredoxin reductase  29.57 
 
 
309 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  32.2 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  34.52 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  30.66 
 
 
458 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1613  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.76 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  30.63 
 
 
306 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  32.41 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  29.57 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>