More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1613 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1613  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
313 aa  624  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5841  Thioredoxin-disulfide reductase  49.83 
 
 
304 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0474919  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.03 
 
 
325 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550418  normal  0.0765759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4596  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.26 
 
 
302 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114387  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.2 
 
 
330 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.03 
 
 
325 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2499  thioredoxin-disulfide reductase  46.44 
 
 
300 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2891  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.05 
 
 
307 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703183  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1516  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.45 
 
 
326 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.83 
 
 
334 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.12 
 
 
348 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  32.55 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  35.16 
 
 
304 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.77 
 
 
551 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  32.8 
 
 
305 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3112  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.99 
 
 
386 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  31.21 
 
 
306 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1021  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.33 
 
 
358 aa  123  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.664925  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.79 
 
 
361 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0648592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  32.99 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  31.02 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  31.88 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.67 
 
 
427 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  32.28 
 
 
308 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
291 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  31.41 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  29.33 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  29.97 
 
 
312 aa  117  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  29.11 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.45 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  30.23 
 
 
309 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  30.06 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.87 
 
 
548 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0975  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.69 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000415137  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.85 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  34.59 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  29.97 
 
 
302 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  29.9 
 
 
318 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.42 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.97 
 
 
579 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  29.33 
 
 
304 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0525  thioredoxin-disulfide reductase  27.21 
 
 
326 aa  108  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1252  Thioredoxin-disulfide reductase  31.15 
 
 
327 aa  108  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  28.3 
 
 
306 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.29 
 
 
547 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  31.05 
 
 
311 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.53 
 
 
302 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  31.51 
 
 
550 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  28.48 
 
 
310 aa  106  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  26.9 
 
 
306 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  31.29 
 
 
309 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.89 
 
 
602 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  32.54 
 
 
304 aa  105  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0907  Thioredoxin-disulfide reductase  31.73 
 
 
547 aa  105  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000675051  normal  0.496773 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  30.8 
 
 
332 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  27.27 
 
 
306 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.21 
 
 
299 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  31.05 
 
 
309 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  28.38 
 
 
304 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0720  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.1 
 
 
394 aa  103  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  29.94 
 
 
326 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  28.48 
 
 
317 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.78 
 
 
301 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  28.97 
 
 
309 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  30.19 
 
 
310 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  30.39 
 
 
311 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0013  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.4 
 
 
300 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  29.6 
 
 
547 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4563  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.27 
 
 
313 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  30.39 
 
 
311 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  28.48 
 
 
317 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2556  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.7 
 
 
305 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.51858  normal  0.0789528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  28.81 
 
 
324 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7926  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 
331 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.949159  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  31.29 
 
 
310 aa  100  4e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  28.62 
 
 
308 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  29.14 
 
 
320 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  28.2 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  29.52 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.76 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1406  thioredoxin reductase  29.64 
 
 
638 aa  98.2  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1595  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.05 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.67 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  30.24 
 
 
456 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  34.83 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  29.15 
 
 
460 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  27.48 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  36.05 
 
 
311 aa  97.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.8 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  28.42 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  28.33 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1203  thioredoxin reductase  29.21 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0940141  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.12 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.12 
 
 
318 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  29.41 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  31.46 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.48 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  29.86 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  28.2 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  28.03 
 
 
318 aa  96.3  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>