More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5841 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5841  Thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0474919  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1613  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.34 
 
 
313 aa  291  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4596  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.83 
 
 
302 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114387  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.81 
 
 
325 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550418  normal  0.0765759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.8 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4276  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.82 
 
 
330 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2499  thioredoxin-disulfide reductase  42.62 
 
 
300 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2891  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.24 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703183  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1516  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.96 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.83 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.62 
 
 
348 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  32.99 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  31.95 
 
 
318 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  31.95 
 
 
318 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.03 
 
 
579 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  34.63 
 
 
331 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  33.33 
 
 
310 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  32.74 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  31.69 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.67 
 
 
427 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  31.71 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  32.99 
 
 
327 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  30.29 
 
 
323 aa  116  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  38.73 
 
 
348 aa  116  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  31.47 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  30.29 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  30.82 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  32.27 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.3 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  30.03 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  31.44 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  33.22 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  26.71 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.29 
 
 
300 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.41 
 
 
302 aa  113  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  31.46 
 
 
308 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.46 
 
 
299 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0767976 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  30.19 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  30.67 
 
 
304 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  31.35 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  33.11 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  29.74 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  33.81 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.08 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.02 
 
 
551 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  33.1 
 
 
344 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  31.1 
 
 
309 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  31.49 
 
 
550 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  31.91 
 
 
330 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0012  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 
299 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  31.67 
 
 
331 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  29.77 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2006  thioredoxin-disulfide reductase  28.01 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.827549  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  29.79 
 
 
309 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
548 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.2 
 
 
291 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  32.87 
 
 
346 aa  109  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.83 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1966  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.44 
 
 
340 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.35316  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  31.71 
 
 
313 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1021  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.92 
 
 
358 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.664925  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  29.29 
 
 
299 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  32.75 
 
 
330 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  29.77 
 
 
326 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  32.63 
 
 
335 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  30.63 
 
 
318 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  28.07 
 
 
316 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28227  predicted protein  29.78 
 
 
547 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0120159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  30.69 
 
 
310 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.28 
 
 
301 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  30.53 
 
 
460 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  29.03 
 
 
302 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  32.51 
 
 
329 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  31.01 
 
 
310 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  30.74 
 
 
333 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  30.74 
 
 
333 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  30.74 
 
 
333 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3154  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.83 
 
 
300 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  32.28 
 
 
317 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  32.51 
 
 
330 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.76 
 
 
318 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  29.97 
 
 
317 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  29.11 
 
 
458 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  29.18 
 
 
332 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  30.6 
 
 
311 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  27.8 
 
 
304 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0975  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.65 
 
 
320 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000415137  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  27.72 
 
 
458 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.04 
 
 
407 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.09 
 
 
318 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  29.51 
 
 
313 aa  102  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.17 
 
 
602 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  28.39 
 
 
310 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  27.36 
 
 
311 aa  102  1e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  35.33 
 
 
311 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  32.18 
 
 
362 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  30.54 
 
 
317 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4563  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.64 
 
 
313 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.09 
 
 
318 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.76 
 
 
318 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>