More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1945 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0360  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.44 
 
 		 291 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000662719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1503  thioredoxin-disulfide reductase  47.06 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.60655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2151  thioredoxin reductase, putative  43.6 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0542  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.89 
 
 		 302 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0912  Thioredoxin-disulfide reductase  41.98 
 
 		 305 aa  225  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0260  Thioredoxin-disulfide reductase  42.61 
 
 		 318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0215312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1622  thioredoxin-disulfide reductase  40.55 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.987193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1252  Thioredoxin-disulfide reductase  37.41 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  34.64 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  34.87 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  34.95 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  32.67 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  34.32 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  34.44 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  33.66 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  35.2 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  35.71 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  32.33 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  30.29 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  33.66 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  35.49 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  31.7 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  32.57 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  33.99 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  31.8 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  33.66 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  32.8 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  32.91 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1696  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.86 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  33.7 
 
 		 348 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0766  thioredoxin reductase  35.18 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0341299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0151  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.77 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000739303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1615  thioredoxin reductase  34.1 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000110255  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  32.45 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  34.97 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  32.24 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0782  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.3 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  33.33 
 
 		 332 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  30.74 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0204  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.93 
 
 		 301 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.642537  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  32.33 
 
 		 306 aa  148  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  32.56 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  32.8 
 
 		 311 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  32.67 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  34.93 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  34.53 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1300  thioredoxin-disulfide reductase  33.68 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  33.58 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  33.7 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1946  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.52 
 
 		 427 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000621838  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  32.23 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  36.74 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  32.65 
 
 		 335 aa  145  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0048  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.62 
 
 		 407 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.282171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  34.07 
 
 		 325 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.67 
 
 		 547 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  34.55 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  35.62 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  34.21 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  34.21 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  34.21 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0698  thioredoxin-disulfide reductase  31.61 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468385  normal  0.685309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  31.86 
 
 		 353 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  33.22 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  31.31 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  33.89 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.56 
 
 		 579 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  30.42 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  33.44 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0145  thioredoxin reductase  31.51 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.47 
 
 		 551 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  32.89 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  31.06 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  31.06 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  31.06 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  32.67 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  33.11 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  31.35 
 
 		 317 aa  142  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1914  thioredoxin reductase  33.55 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.58 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  33.11 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  29.81 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  34.09 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2361  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.69 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244772  hitchhiker  0.000649797 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  34.21 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  32.99 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  29.69 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  34.47 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  33.44 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  32.49 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  32.69 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0619  thioredoxin reductase  31.97 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000125941  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  35.08 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.78 
 
 		 318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4671  thioredoxin reductase 2  31.29 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  31.19 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  30.57 
 
 		 330 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>