128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0538 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0538  thioredoxin reductase  100 
 
 
323 aa  631  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.677073 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2008  thioredoxin reductase  57.89 
 
 
306 aa  278  9e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.141519 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4412  Thioredoxin reductase-like protein  52.96 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2193  thioredoxin reductase  50.67 
 
 
311 aa  229  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0781  Thioredoxin reductase-like protein  43.54 
 
 
333 aa  228  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2481  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.54 
 
 
245 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.57969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0889  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.57 
 
 
248 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0393  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.7 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.19159  normal  0.171369 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.56 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0542  thioredoxin reductase-like protein  33.84 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0652846  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1200  thioredoxin reductase  37.17 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  43.48 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0401  Thioredoxin-disulfide reductase  39.76 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0543651 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1907  Thioredoxin-disulfide reductase  37.76 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.327863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0568  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.16 
 
 
192 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.842156  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  32.94 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4421  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.14 
 
 
572 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  28.35 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3112  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.59 
 
 
386 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  27.56 
 
 
339 aa  52.8  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5027  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.3 
 
 
563 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 
573 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0603  thioredoxin reductase  30.63 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00896552  hitchhiker  0.000000000102753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  34.78 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6126  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.36 
 
 
575 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  28.32 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1613  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.43 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  32.14 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4356  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.77 
 
 
568 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4596  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 
302 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114387  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4894  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.78 
 
 
588 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  33.7 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3787  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.24 
 
 
199 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1082  thioredoxin reductase  28.95 
 
 
310 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  27.93 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59792  Thioredoxin reductase  26.45 
 
 
319 aa  49.7  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2606  Thioredoxin-disulfide reductase  36.78 
 
 
309 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234008  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
318 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  31.86 
 
 
306 aa  49.3  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13251  putative thioredoxin reductase  29.46 
 
 
458 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2499  thioredoxin-disulfide reductase  35 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  30.43 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6387  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.98 
 
 
565 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  36.71 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  25.44 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1190  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.82 
 
 
560 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  unclonable  0.0000120152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  31.58 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5841  Thioredoxin-disulfide reductase  42.31 
 
 
304 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0474919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  34.94 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0213  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.88 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13151  putative thioredoxin reductase  29.69 
 
 
458 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.88 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.82 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0272  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.67 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3111  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.75 
 
 
193 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684125  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13401  putative thioredoxin reductase  28.91 
 
 
458 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327116  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0680  thioredoxin reductase  33.04 
 
 
457 aa  47  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1981  thioredoxin reductase  33.04 
 
 
460 aa  47  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1047  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.95 
 
 
348 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.333323  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  28.07 
 
 
325 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0623  thioredoxin reductase  28.93 
 
 
459 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66148  normal  0.453769 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02401  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.88 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.250311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1748  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.25 
 
 
559 aa  45.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1595  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.75 
 
 
345 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4454  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.67 
 
 
577 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  35.06 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1469  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.36 
 
 
556 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0649357  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6359  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.36 
 
 
556 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120399  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.98 
 
 
548 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  60.61 
 
 
432 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1925  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.62 
 
 
561 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0956827  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3313  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.59 
 
 
548 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  30.95 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.36 
 
 
423 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.32621 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0901  Thioredoxin-disulfide reductase  30.39 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  34.52 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  30.89 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  31.3 
 
 
458 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0357  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.21 
 
 
185 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.712618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1247  thioredoxin reductase  29.31 
 
 
458 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1150  thioredoxin-disulfide reductase  31.86 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1945  thioredoxin-disulfide reductase  27.71 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  31.03 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2000  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.5 
 
 
200 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  26.87 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  32.56 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  25.21 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1699  thioredoxin-disulfide reductase  31.34 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0012  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.3 
 
 
566 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.492266  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  35.21 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  34.85 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  29.82 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  30.7 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  29.91 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  25.62 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  26.5 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2414  thioredoxin reductase  28.83 
 
 
348 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  30.97 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0369  response regulator receiver modulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.04 
 
 
567 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>