More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0970 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0970  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  56.12 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0787  nucleoside diphosphate kinase  53.9 
 
 		 141 aa  151  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.365993  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1439  nucleoside diphosphate kinase  47.83 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0019677  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0990  nucleoside diphosphate kinase  53.96 
 
 		 137 aa  146  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  48.55 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1488  nucleoside diphosphate kinase  52.52 
 
 		 137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  53.24 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2625  nucleoside-diphosphate kinase  51.08 
 
 		 139 aa  143  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2559  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.17056e-35 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1702  nucleoside diphosphate kinase  53.96 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1654  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000296551  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  52.14 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2236  nucleoside diphosphate kinase  51.45 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  47.48 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2122  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 141 aa  140  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2231  nucleoside diphosphate kinase  48.23 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00256702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2368  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0653822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2190  Nucleoside-diphosphate kinase  51.8 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2319  nucleoside diphosphate kinase  48.23 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0482879  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  53.24 
 
 		 137 aa  140  8e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  49.65 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  51.06 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  47.83 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2180  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0298319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3466  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1580  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000001622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  51.8 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  51.11 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0685  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1629  nucleoside diphosphate kinase  47.52 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243843  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0339  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0590  nucleoside diphosphate kinase  47.52 
 
 		 142 aa  137  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0697929  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2009  nucleoside diphosphate kinase  51.45 
 
 		 141 aa  137  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000148983  normal  0.309195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2686  nucleoside diphosphate kinase  47.48 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.77267e-18  normal  0.505951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1110  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000208887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  51.08 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0229  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.559671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2183  Nucleoside-diphosphate kinase  46.81 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450102  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1601  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00859967  normal  0.254258 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2961  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0984592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2288  nucleoside diphosphate kinase  47.83 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.416222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2182  nucleoside diphosphate kinase  48.57 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  50.36 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2012  nucleoside diphosphate kinase  47.83 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.684832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2485  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  51.45 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2216  Nucleoside-diphosphate kinase  50.36 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.529954  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0204  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  51.08 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0488  nucleoside diphosphate kinase  48.55 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.94112  normal  0.716052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5149  Nucleoside-diphosphate kinase  47.48 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.639842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1420  nucleoside diphosphate kinase  48.23 
 
 		 141 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.803456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3244  nucleoside diphosphate kinase  46.04 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189269  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10693  nucleoside diphosphate kinase  47.1 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.371269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1086  nucleoside diphosphate kinase  47.52 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.895381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  48.23 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  48.23 
 
 		 141 aa  133  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0894  Nucleoside-diphosphate kinase  44.6 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  49.64 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1974  nucleoside diphosphate kinase  47.1 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.209722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0030  nucleoside diphosphate kinase  50.72 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.348386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  48.2 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  49.65 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 143 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  48.23 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1166  nucleoside diphosphate kinase  47.52 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  46.1 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  48.92 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3873  nucleoside diphosphate kinase  46.04 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.775561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0968  nucleoside diphosphate kinase  49.64 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00326747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>