45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1705 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 		 284 aa  591  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  43.54 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  38.01 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.55 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.31 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.96 
 
 		 264 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.96 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.15 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.39 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.46 
 
 		 271 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.46 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.92 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  26.56 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.17 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.17 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.14 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.17 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.95 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.36 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.34 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.36 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.37 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.9 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4139  uncharacterized protein linocin/CFP29  27.68 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.101347  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  28.93 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.45 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  24.69 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.18 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.96 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.3 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.47 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.18 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.1 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  25.73 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.64 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.1 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.53 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4292  uncharacterized protein linocin/CFP29  27.13 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.92184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.45 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4270  uncharacterized protein linocin/CFP29  27.13 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  26.19 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  26.19 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.74 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0561  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.19 
 
 		 346 aa  52.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227795  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.29 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>