44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0417 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 
264 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.56 
 
 
270 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  39.78 
 
 
270 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.05 
 
 
278 aa  186  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  35.25 
 
 
278 aa  182  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.96 
 
 
284 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.2 
 
 
263 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.32 
 
 
262 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.42 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.16 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.54 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  27.39 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  28.1 
 
 
358 aa  82.4  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.77 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  26.36 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.93 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.81 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.86 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.1 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.12 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.1 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.93 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  26.64 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.72 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.93 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.93 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.03 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.1 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.38 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.88 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4270  uncharacterized protein linocin/CFP29  24.72 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.71 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4292  uncharacterized protein linocin/CFP29  25.18 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.92184  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  25 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.1 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4139  uncharacterized protein linocin/CFP29  25.27 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.101347  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.1 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.18 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.69 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  22.22 
 
 
267 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  23.68 
 
 
274 aa  58.9  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.65 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.42 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  20.15 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>