33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6188 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  90.2 
 
 		 267 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  82.04 
 
 		 267 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  78.28 
 
 		 271 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  76.76 
 
 		 271 aa  374  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  77.18 
 
 		 271 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  77.18 
 
 		 271 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  76.35 
 
 		 271 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  75.1 
 
 		 271 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  75.1 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  64.85 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  61.25 
 
 		 265 aa  294  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  60.17 
 
 		 265 aa  293  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  59.17 
 
 		 265 aa  289  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  60.83 
 
 		 265 aa  288  7e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  59.84 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  59.17 
 
 		 282 aa  284  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.56 
 
 		 267 aa  279  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  55 
 
 		 265 aa  262  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  44.49 
 
 		 280 aa  191  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  42.74 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  41.1 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  38.43 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.92 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.58 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.92 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.42 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.42 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.58 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.8 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.42 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.1 
 
 		 284 aa  52  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.78 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>