37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5413 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 
271 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  93.58 
 
 
271 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  93.58 
 
 
271 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  90.41 
 
 
271 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  90.77 
 
 
271 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  88.93 
 
 
271 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  88.56 
 
 
271 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  79.32 
 
 
267 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  78.49 
 
 
267 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  78.28 
 
 
245 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  67.04 
 
 
268 aa  360  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  62.78 
 
 
274 aa  332  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  62.12 
 
 
265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  61.74 
 
 
265 aa  325  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  61.98 
 
 
265 aa  323  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  60.23 
 
 
265 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  58.33 
 
 
282 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.43 
 
 
267 aa  305  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.13 
 
 
265 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.42 
 
 
266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  44.4 
 
 
280 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  41.03 
 
 
276 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  36.36 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.58 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.58 
 
 
265 aa  150  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.58 
 
 
265 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.95 
 
 
273 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.95 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.77 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.24 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.92 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.1 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.23 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.19 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.62 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.29 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  20.79 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>