36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5666 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 		 271 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  99.63 
 
 		 271 aa  540  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  92.62 
 
 		 271 aa  507  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  91.14 
 
 		 271 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  91.14 
 
 		 271 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  90.77 
 
 		 271 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  88.56 
 
 		 271 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  76.05 
 
 		 267 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  75.47 
 
 		 267 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  75.1 
 
 		 245 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  66.42 
 
 		 268 aa  359  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  64.02 
 
 		 274 aa  341  7e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  59.47 
 
 		 265 aa  321  8e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  59.47 
 
 		 265 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  60.84 
 
 		 265 aa  318  6e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  58.71 
 
 		 265 aa  316  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  56.44 
 
 		 282 aa  305  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  54.72 
 
 		 267 aa  303  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.89 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  43.21 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  44.27 
 
 		 266 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  40.75 
 
 		 276 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  35.61 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.83 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.04 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.32 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.32 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.97 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.46 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.86 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.46 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.86 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.1 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.05 
 
 		 278 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.57 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.59 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.942345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>