37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1761 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  38.2 
 
 
273 aa  195  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.08 
 
 
265 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.08 
 
 
265 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  41.11 
 
 
266 aa  188  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  36.43 
 
 
265 aa  175  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.36 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  35.47 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  33.83 
 
 
265 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.36 
 
 
282 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  35.58 
 
 
274 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.39 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  33.83 
 
 
267 aa  152  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  32.84 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.34 
 
 
265 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.59 
 
 
268 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  36.13 
 
 
280 aa  148  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.95 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  33.21 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  32.58 
 
 
267 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.71 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.33 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.33 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.34 
 
 
271 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.95 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.97 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.95 
 
 
271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.92 
 
 
245 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.01 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.7 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.38 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.28 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.37 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.47 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.73 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.28 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.53 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>