36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1316 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 		 278 aa  573  1.0000000000000001e-163  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.04 
 
 		 278 aa  322  4e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  38.01 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.18 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  35.25 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.55 
 
 		 270 aa  148  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.55 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.84 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.63 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.74 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.51 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.46 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.46 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.38 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.47 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  19.42 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.3 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.58 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.38 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1254  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.96 
 
 		 359 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.574463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.17 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  23.11 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  22.22 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.15 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.43 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.15 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.4 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  20.79 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.02 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  20.97 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.71 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0207  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  23.23 
 
 		 373 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4139  uncharacterized protein linocin/CFP29  21.22 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.101347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.66 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.46 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  20.94 
 
 		 271 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>