40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0142 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  99.25 
 
 		 265 aa  529  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  42.7 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  38.49 
 
 		 266 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.97 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.08 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.36 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.5 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  34.72 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.56 
 
 		 280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  35.58 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  33.71 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.2 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.47 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  33.09 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  33.83 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  33.58 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.58 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.08 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.08 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.7 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.32 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.94 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.32 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.77 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  30.15 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.81 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  30.42 
 
 		 245 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.72 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.74 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.94 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.94 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.72 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.81 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.93 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.36 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.46 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4139  uncharacterized protein linocin/CFP29  26.98 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.101347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4270  uncharacterized protein linocin/CFP29  26.79 
 
 		 272 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4292  uncharacterized protein linocin/CFP29  26.69 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.92184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>