37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4015 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 		 265 aa  529  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  64.15 
 
 		 274 aa  345  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  63.5 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  55.89 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.89 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  53.96 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.89 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.89 
 
 		 271 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.13 
 
 		 271 aa  291  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.13 
 
 		 271 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.13 
 
 		 271 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.13 
 
 		 271 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  53.23 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  54.75 
 
 		 271 aa  285  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  52.45 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  53.21 
 
 		 265 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  53.41 
 
 		 267 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  52.47 
 
 		 282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  55 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.28 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  46.49 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  41.42 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.59 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.36 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.84 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  33.58 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  33.58 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.97 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.89 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.46 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.66 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.67 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.52 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.74 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  25 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  22.96 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.36 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.942345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>