37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1404 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 
271 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 
271 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  98.52 
 
 
271 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  93.73 
 
 
271 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  91.51 
 
 
271 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  91.14 
 
 
271 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  93.58 
 
 
271 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  78.71 
 
 
267 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  77.36 
 
 
267 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  77.18 
 
 
245 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  67.92 
 
 
268 aa  363  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  62.22 
 
 
274 aa  337  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  60.98 
 
 
265 aa  327  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  62.36 
 
 
265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  60.61 
 
 
265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  59.47 
 
 
265 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  57.93 
 
 
282 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.47 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  55.13 
 
 
265 aa  289  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.52 
 
 
280 aa  215  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  41.51 
 
 
276 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  44.27 
 
 
266 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  36.74 
 
 
265 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.08 
 
 
265 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.2 
 
 
265 aa  149  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.08 
 
 
265 aa  148  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.57 
 
 
273 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.33 
 
 
264 aa  136  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.15 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.24 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.93 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.17 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.81 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.63 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.72 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.05 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.15 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>