41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0974 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  48.15 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  49.26 
 
 		 265 aa  244  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  48.52 
 
 		 268 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  48.21 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  46.3 
 
 		 276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  47.41 
 
 		 265 aa  241  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  46.3 
 
 		 265 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  47.04 
 
 		 265 aa  237  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  45.93 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  44.81 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.32 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  46.49 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.52 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.52 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.15 
 
 		 271 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  47.06 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  45.15 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  44.4 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  43.21 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  43.21 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  44.49 
 
 		 245 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  40.43 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.56 
 
 		 265 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.56 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.35 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  36.13 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.96 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.02 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.88 
 
 		 264 aa  72  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  28.57 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.58 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.45 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.1 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  23.25 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4270  uncharacterized protein linocin/CFP29  30.38 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.91 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4292  uncharacterized protein linocin/CFP29  29.62 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.92184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4139  uncharacterized protein linocin/CFP29  30 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.101347  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1418  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  29 
 
 		 352 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.377117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1880  uncharacterized linocin/CFP29-like protein  29 
 
 		 358 aa  43.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000112619  normal  0.747435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>