37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3309 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3309  Linocin_M18 bacteriocin protein  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0325181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1590  Linocin M18 bacteriocin protein  68.56 
 
 		 274 aa  374  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7000  Linocin_M18 bacteriocin protein  67.54 
 
 		 271 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5472  Linocin_M18 bacteriocin protein  67.55 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122868  normal  0.0319656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3834  hypothetical protein  66.16 
 
 		 267 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1404  Linocin_M18 bacteriocin protein  67.92 
 
 		 271 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6425  Linocin_M18 bacteriocin protein  67.92 
 
 		 271 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.572619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6415  Linocin_M18 bacteriocin protein  66.79 
 
 		 271 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  0.258544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7088  Linocin_M18 bacteriocin protein  67.55 
 
 		 271 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.819744  normal  0.114126 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5413  Linocin_M18 bacteriocin protein  67.04 
 
 		 271 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0315923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5666  Linocin_M18 bacteriocin protein  66.42 
 
 		 271 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.448725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5123  Linocin_M18 bacteriocin protein  62.5 
 
 		 265 aa  350  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439561  normal  0.576043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10813  29 kDa antigen cfp29  61.36 
 
 		 265 aa  345  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3202  Linocin_M18 bacteriocin protein  63.88 
 
 		 265 aa  345  6e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.579175  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4015  Linocin_M18 bacteriocin protein  63.5 
 
 		 265 aa  337  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1626  Linocin_M18 bacteriocin protein  59.09 
 
 		 265 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4594  Linocin_M18 bacteriocin protein  61.36 
 
 		 282 aa  327  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142366  hitchhiker  0.00338806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4563  Linocin_M18 bacteriocin protein  59.25 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6188  Linocin_M18 bacteriocin protein  64.85 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0974  Linocin_M18 bacteriocin protein  48.52 
 
 		 280 aa  230  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0935693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2248  Linocin_M18 bacteriocin protein  43.02 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00352886  decreased coverage  0.00701181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3837  Linocin_M18 bacteriocin protein  44.32 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257523  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15970  Linocin_M18 bacteriocin protein  37.12 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1969  Linocin_M18 bacteriocin protein  32.71 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719362  normal  0.138388 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1761  Linocin_M18 bacteriocin protein  34.59 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00497858  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0002  Linocin_M18 bacteriocin protein  31.44 
 
 		 265 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000133397  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0144  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.81 
 
 		 265 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0142  Linocin_M18 bacteriocin protein  29.81 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1095  Linocin_M18 bacteriocin protein  27.48 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.236732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1283  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.72 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0692096  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1504  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.25 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0417  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.69 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1705  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.45 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0119  Linocin_M18 bacteriocin protein  24.21 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000660345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4282  Linocin_M18 bacteriocin protein  26.72 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.180613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1316  Linocin_M18 bacteriocin protein  21.38 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600572  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3018  Linocin_M18 bacteriocin protein  25.3 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.942345 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>