106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4342 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4342  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  343  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0971  FHA domain-containing protein  48.4 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6885  FHA domain-containing protein  40.48 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  46.15 
 
 		 856 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  53.4 
 
 		 933 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  46.81 
 
 		 851 aa  101  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  55.66 
 
 		 849 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  51.52 
 
 		 895 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  48.08 
 
 		 838 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  40.74 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  43.55 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0077  FHA domain containing protein  47.06 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.43292  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  46.58 
 
 		 312 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2551  FHA domain containing protein  36.36 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2647  FHA domain containing protein  36.36 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  39.66 
 
 		 267 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1309  FHA domain-containing protein  35.06 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0844943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2707  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  47.83 
 
 		 457 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0226952  unclonable  0.000000000187188 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26930  FHA domain-containing protein  40.85 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.583878  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0533  FHA domain-containing protein  40.38 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2456  FHA domain-containing protein  33.77 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00798291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  33.77 
 
 		 233 aa  48.1  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  43.75 
 
 		 387 aa  47.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3525  FHA domain-containing protein  47.27 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.995835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  35.05 
 
 		 866 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  35.05 
 
 		 866 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  43.24 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  43.24 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.71 
 
 		 910 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  35.58 
 
 		 385 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4219  Forkhead-associated protein  41.33 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  33.82 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  38.6 
 
 		 407 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3938  FHA domain-containing protein  29.46 
 
 		 529 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0365  FHA domain containing protein  31.33 
 
 		 118 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  34.02 
 
 		 866 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0150  diguanylate cyclase  37.76 
 
 		 289 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0032  FHA domain containing protein  42 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  43.66 
 
 		 338 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0139  diguanylate cyclase  37.76 
 
 		 289 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0732  FHA domain containing protein  30.21 
 
 		 151 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0031  FHA domain containing protein  42 
 
 		 235 aa  45.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1341  FHA domain containing protein  42.42 
 
 		 374 aa  45.1  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0382  hypothetical protein  32.53 
 
 		 318 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0186101  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  37.65 
 
 		 863 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  38.46 
 
 		 238 aa  44.7  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0998  FHA domain-containing protein  27.01 
 
 		 337 aa  44.7  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1775  hypothetical protein  32.88 
 
 		 302 aa  44.3  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  35.63 
 
 		 861 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0761  FHA domain containing protein  30.21 
 
 		 151 aa  44.3  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00800  FHA domain-containing protein  43.48 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.151264  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  44.12 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1581  FHA domain containing protein  33.9 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.10755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5478  FHA domain containing protein  36.23 
 
 		 673 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366631  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00240  FHA domain-containing protein  44 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0020  FHA domain-containing protein  32.95 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.711255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0028  FHA domain-containing protein  32.95 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377029  hitchhiker  0.00774619 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3863  FHA domain-containing protein  38.03 
 
 		 503 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.312796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0020  FHA domain-containing protein  32.95 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.844855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  35.29 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  34.69 
 
 		 863 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2147  FHA domain-containing protein  42.86 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2044  FHA domain-containing protein  45.83 
 
 		 405 aa  43.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  34.29 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.85 
 
 		 863 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  36.76 
 
 		 408 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0176  FHA domain containing protein  42 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.74043 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1302  FHA domain containing protein  33.78 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3427  hypothetical protein  38.03 
 
 		 503 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  36.92 
 
 		 310 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.65 
 
 		 606 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0116  FHA domain containing protein-like protein  45.45 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0036  FHA domain protein  33.33 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3742  FHA domain-containing protein  38.89 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  47.92 
 
 		 252 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  40 
 
 		 411 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0040  FHA domain-containing protein  32.58 
 
 		 343 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316626  normal  0.0320311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  43.14 
 
 		 306 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  44.68 
 
 		 179 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  39.13 
 
 		 474 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1738  FHA domain containing protein  36.99 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0132  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 289 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  36.47 
 
 		 869 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0076  FHA domain containing protein  48.84 
 
 		 166 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1079  FHA domain containing protein  36.92 
 
 		 317 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.153112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2826  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.82 
 
 		 1065 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0083  FHA domain containing protein  40.74 
 
 		 394 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3669  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.92 
 
 		 451 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163956  decreased coverage  0.0000814904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  39.58 
 
 		 241 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  48.94 
 
 		 851 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  45.28 
 
 		 414 aa  41.6  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0027  forkhead-associated protein  44.44 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3956  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.66 
 
 		 455 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.382581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4620  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 		 479 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.997468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0050  FHA domain-containing protein  32.58 
 
 		 343 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0059  FHA domain-containing protein  32.58 
 
 		 343 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0562745 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  37.68 
 
 		 770 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0030  Forkhead-associated protein  37.5 
 
 		 153 aa  41.2  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4002  FHA domain-containing protein-like protein  38.57 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759759  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2726  FHA domain containing protein  37.74 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>