53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6885 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6885  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  384  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0971  FHA domain-containing protein  45.59 
 
 		 183 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  50.56 
 
 		 895 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4342  FHA domain-containing protein  43.84 
 
 		 182 aa  94.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  47.37 
 
 		 856 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  38.21 
 
 		 851 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.89 
 
 		 838 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  46.08 
 
 		 849 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  46.32 
 
 		 933 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3669  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.18 
 
 		 451 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163956  decreased coverage  0.0000814904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.33 
 
 		 851 aa  55.1  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  52 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  43.21 
 
 		 338 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0032  FHA domain containing protein  58.33 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  36.84 
 
 		 279 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0031  FHA domain containing protein  57.14 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  41.98 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0176  FHA domain containing protein  53.06 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.74043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00240  FHA domain-containing protein  55.1 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  41.98 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0026  FHA domain containing protein  52.94 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  49.02 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  44.64 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0036  FHA domain protein  44.64 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  46.55 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1775  hypothetical protein  26.85 
 
 		 302 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4219  Forkhead-associated protein  39.73 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2551  FHA domain containing protein  34.92 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2647  FHA domain containing protein  34.92 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  39.19 
 
 		 1346 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0026  FHA domain-containing protein  50.98 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26930  FHA domain-containing protein  50.98 
 
 		 237 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.583878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 312 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1918  FHA domain containing protein  32.05 
 
 		 99 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0041  FHA domain containing protein  45.83 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2044  FHA domain containing protein  39.39 
 
 		 121 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  41.1 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1309  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2456  FHA domain-containing protein  37.5 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00798291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  30.69 
 
 		 848 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 385 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1581  FHA domain containing protein  33.75 
 
 		 145 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.10755 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2114  FHA domain containing protein  39.39 
 
 		 121 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2707  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  36.46 
 
 		 457 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0226952  unclonable  0.000000000187188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0140  FHA domain-containing protein  48.44 
 
 		 533 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425814  hitchhiker  0.00649643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3039  FHA domain containing protein  41.27 
 
 		 414 aa  41.6  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  36.54 
 
 		 387 aa  41.6  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00230  FHA domain-containing protein  42 
 
 		 163 aa  41.6  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  43.86 
 
 		 777 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1816  FHA domain-containing protein  39.39 
 
 		 121 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4430  FHA domain-containing protein  46.88 
 
 		 440 aa  41.2  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.206404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  43.18 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>