52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0998 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0998  FHA domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  702    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1859  forkhead-associated protein  37.84 
 
 
341 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4369  FHA domain-containing protein  30.48 
 
 
314 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477946  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3060  FHA domain-containing protein  28.09 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0019  FHA domain-containing protein  30.72 
 
 
335 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0800  FHA domain-containing protein  30.72 
 
 
335 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2489  FHA domain-containing protein  30.25 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0633  FHA domain-containing protein  30.25 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.723883  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0618  FHA domain-containing protein  30.25 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2218  FHA domain-containing protein  30.25 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2865  FHA domain-containing protein  30.25 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0513  FHA domain-containing protein  30.89 
 
 
335 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3161  FHA domain-containing protein  29.69 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3131  FHA domain-containing protein  29.69 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5140  FHA domain-containing protein  29.69 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4988  FHA domain-containing protein  29.69 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5719  FHA domain-containing protein  29.69 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225135  normal  0.254458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4508  FHA domain-containing protein  29.69 
 
 
333 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.91985  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3726  forkhead-associated  29.59 
 
 
318 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3184  FHA domain containing protein  30.62 
 
 
306 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148023  normal  0.306056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6306  FHA domain containing protein  27.84 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2158  FHA domain containing protein  28.26 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.261769  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.33 
 
 
838 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
851 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4216  FHA domain-containing protein  37.68 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000473857  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0534  FHA domain-containing protein  39.06 
 
 
272 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.895952  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1521  FHA domain-containing protein  35.53 
 
 
295 aa  49.3  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
848 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2708  FHA domain containing protein  34.21 
 
 
263 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.042803  hitchhiker  0.0000000030829 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5037  FHA domain containing protein  32.89 
 
 
235 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.86 
 
 
799 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  47.27 
 
 
162 aa  46.2  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1482  FHA domain containing protein  38.6 
 
 
237 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.30072  normal  0.365502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.85 
 
 
910 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1456  FHA domain containing protein  38.6 
 
 
237 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1501  FHA domain-containing protein  43.14 
 
 
155 aa  46.2  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.821183  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.27 
 
 
799 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2063  FHA domain containing protein  45.76 
 
 
209 aa  46.2  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  36.59 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2044  FHA domain-containing protein  35.23 
 
 
405 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130358  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.04 
 
 
890 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4342  FHA domain-containing protein  27.01 
 
 
182 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112903  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0424  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4347  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
204 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4433  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
204 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  0.176382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1334  FHA domain-containing protein  30.56 
 
 
520 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4727  FHA domain-containing protein  38.1 
 
 
204 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926076  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0040  FHA domain-containing protein  35.38 
 
 
580 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0382  hypothetical protein  29.7 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0186101  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  36.62 
 
 
463 aa  43.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4219  Forkhead-associated protein  35.09 
 
 
224 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  42.86 
 
 
188 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>