252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2337 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2337  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
292 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1449  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 
278 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1467  alpha/beta hydrolase fold  44.19 
 
 
278 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4470  alpha/beta hydrolase fold  44.32 
 
 
267 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0909  alpha/beta hydrolase fold  43.8 
 
 
267 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2846  alpha/beta hydrolase fold  43.41 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.442208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4553  alpha/beta hydrolase fold  41.86 
 
 
275 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 
272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  25.77 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.46 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 
271 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  29.41 
 
 
287 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  28.57 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.33 
 
 
396 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  42.06 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2231  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
242 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0937433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  54.24 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  31.55 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.59 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  32.8 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  32.8 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  32.8 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
226 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
262 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
287 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  21.83 
 
 
270 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2211  alpha/beta fold family hydrolase  24.19 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000336996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
278 aa  52  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  27.54 
 
 
263 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
275 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.46 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  34.78 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 
263 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  32.32 
 
 
265 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  32 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  29.56 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.37 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 
282 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 
248 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 
327 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  25.11 
 
 
277 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  23.25 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0916  alpha/beta hydrolase fold protein  36.49 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 
392 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4087  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase  34.97 
 
 
556 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.779957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  31.62 
 
 
314 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
236 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 
302 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2266  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  34.78 
 
 
259 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 
265 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2516  hydrolase, alpha/beta fold family  23.26 
 
 
242 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
263 aa  49.3  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
257 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2435  hydrolase, alpha/beta fold family  23.72 
 
 
242 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
271 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.32 
 
 
334 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
294 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  41.82 
 
 
229 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2252  alpha/beta fold family hydrolase  23.26 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0246146  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  25.97 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2417  alpha/beta fold family hydrolase  23.26 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.286524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
316 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  21.76 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  31.25 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  24.67 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.24 
 
 
397 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>