More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0410 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0410  integrase, catalytic region  100 
 
 		 141 aa  283  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3089  integrase catalytic region  91.85 
 
 		 296 aa  258  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1614  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1068  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3688  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0620  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5497  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.295724  normal  0.115233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2243  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0365379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2371  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0574  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4620  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3700  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.484261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2863  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4642  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4633  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 301 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2753  integrase, catalytic region  46.26 
 
 		 246 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4468  hypothetical protein  46.26 
 
 		 267 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3068  integrase catalytic region  46.26 
 
 		 304 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1384  integrase catalytic region  45.58 
 
 		 304 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6260  integrase catalytic region  42.11 
 
 		 291 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3664  Integrase catalytic region  38.58 
 
 		 294 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11217  normal  0.13781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4401  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.518435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  32.33 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  36.75 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3327  Integrase catalytic region  36.43 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2168  Integrase catalytic region  36.43 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0614321  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  30.83 
 
 		 386 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  30.83 
 
 		 386 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  30.83 
 
 		 386 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  30.83 
 
 		 386 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  30.83 
 
 		 386 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  30.83 
 
 		 386 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  32.2 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0616  integrase catalytic subunit  40.16 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.243414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1127  integrase catalytic subunit  34.33 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.70947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1980  integrase catalytic subunit  34.33 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.340546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1989  integrase catalytic subunit  34.33 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.866629  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2949  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2199  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1829  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1484  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2011  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.130464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0652  integrase catalytic subunit  34.33 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00967506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1991  integrase catalytic subunit  34.33 
 
 		 260 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  33.08 
 
 		 293 aa  70.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2945  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  31.85 
 
 		 288 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19707e-26 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  34.59 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  34.59 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  34.59 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  33.08 
 
 		 302 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  34.59 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  34.59 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4705  integrase catalytic subunit  39.42 
 
 		 296 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0186  hypothetical protein  32.35 
 
 		 294 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0198  hypothetical protein  32.35 
 
 		 294 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0570  hypothetical protein  32.35 
 
 		 294 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1111  hypothetical protein  32.35 
 
 		 294 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1576  hypothetical protein  32.35 
 
 		 294 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4449  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0972291  normal  0.591502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0132  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3065  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2651  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4460  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3550  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3189  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1727  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1073  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0656  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2008  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2006  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1928  integrase catalytic subunit  35.4 
 
 		 269 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4596  integrase catalytic region  35.4 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.930794 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4660  integrase catalytic region  35.4 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.462988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2153  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525672 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5758  integrase catalytic region  30.71 
 
 		 512 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5652  integrase catalytic region  30.71 
 
 		 512 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1510  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1533  integrase catalytic subunit  40.65 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0356  transposase  30.66 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  34.95 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  34.95 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4653  integrase catalytic region  35.4 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  40.34 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  40.34 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  40.34 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  40.34 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  40.34 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  40.34 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  40.34 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>