90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0994 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0994  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  798    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.404838  hitchhiker  0.0000000117748 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1777  major facilitator superfamily permease  30.51 
 
 
221 aa  78.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.73 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  25.91 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.11 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.11 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  23.3 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
410 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2260  putative permease  24.86 
 
 
409 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3065  putative permease  24.36 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  22.99 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3723  major facilitator superfamily permease  29.73 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2303  putative permease  23.82 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0356106 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2277  permease  23.82 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2123  permease  23.82 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.042179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2061  macrolide efflux protein  23.82 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  22.07 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2097  major facilitator transporter  23.26 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  22.83 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.22 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.22 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2311  permease, putative  22.54 
 
 
409 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2057  macrolide efflux protein  23.63 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2387  putative permease  22.51 
 
 
409 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.23 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  21.33 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  24.03 
 
 
427 aa  50.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  25.08 
 
 
427 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 
440 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  22.44 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  22.45 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  22.02 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  23.23 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  23.23 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  23.4 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  22.26 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  21.56 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0918  major facilitator superfamily permease  22.82 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  23.04 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
414 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2448  major facilitator transporter  23.38 
 
 
403 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00172355  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  23.55 
 
 
424 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  30.26 
 
 
415 aa  47  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.51 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  17.56 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  17.56 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  22.38 
 
 
416 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  21.2 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3278  major facilitator transporter  19.41 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  23.3 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1780  transporter, putative  26.44 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
415 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  21.02 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  22.68 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  23.81 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  23.2 
 
 
415 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  22.76 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
444 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  22.76 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 
409 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  21.19 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  23.3 
 
 
416 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  22.54 
 
 
420 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  20.74 
 
 
433 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  23.11 
 
 
431 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  24.32 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  24.65 
 
 
403 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  23.32 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  21.23 
 
 
423 aa  43.9  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3256  putative permease  26.79 
 
 
314 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 
442 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3139  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 
409 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 
415 aa  43.9  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  27.21 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  21.82 
 
 
405 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 
411 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  20.9 
 
 
408 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  23.95 
 
 
410 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  20.9 
 
 
408 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>