16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1777 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1777  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
221 aa  433  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0994  major facilitator transporter  30.51 
 
 
407 aa  86.3  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.404838  hitchhiker  0.0000000117748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2387  putative permease  29.46 
 
 
409 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2311  permease, putative  29.46 
 
 
409 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2260  putative permease  26.74 
 
 
409 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3065  putative permease  26.44 
 
 
409 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2123  permease  28.68 
 
 
409 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.042179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2057  macrolide efflux protein  28.68 
 
 
409 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2277  permease  28.68 
 
 
409 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2303  putative permease  28.68 
 
 
409 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0356106 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2061  macrolide efflux protein  28.68 
 
 
409 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2097  major facilitator transporter  25.73 
 
 
409 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3723  major facilitator superfamily permease  29.66 
 
 
428 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  27.53 
 
 
413 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  27.53 
 
 
413 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
431 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>