26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3723 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3723  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
428 aa  857    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2260  putative permease  26.87 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3065  putative permease  26.25 
 
 
409 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2097  major facilitator transporter  25.87 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2311  permease, putative  26.25 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2387  putative permease  26.5 
 
 
409 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2061  macrolide efflux protein  26.98 
 
 
409 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2123  permease  26.98 
 
 
409 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.042179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2277  permease  26.98 
 
 
409 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2303  putative permease  26.98 
 
 
409 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0356106 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2057  macrolide efflux protein  26.98 
 
 
409 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.21 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0994  major facilitator transporter  29.73 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.404838  hitchhiker  0.0000000117748 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0055  hypothetical protein  20.68 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.319346  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000676  permease  24.09 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  22.79 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.38 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  22.39 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.51 
 
 
414 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  24.22 
 
 
424 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.1 
 
 
417 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1777  major facilitator superfamily permease  29.31 
 
 
221 aa  43.9  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  20.81 
 
 
406 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  24.28 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  20.81 
 
 
406 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 
415 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>