More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3278 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3278  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  822    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.79 
 
 
1833 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  23.1 
 
 
426 aa  86.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  31.98 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  23.53 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.74 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3065  putative permease  22.83 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2260  putative permease  22.83 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  27.59 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.46 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.46 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  24.94 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  27.57 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.88 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  27.38 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2387  putative permease  22.25 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.94664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2097  major facilitator transporter  21.92 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  25.37 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2311  permease, putative  21.98 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2123  permease  21.98 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.042179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2061  macrolide efflux protein  21.98 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2277  permease  21.98 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.539842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2303  putative permease  21.98 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0356106 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.17 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2057  macrolide efflux protein  21.98 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  21.71 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.68 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.68 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24.83 
 
 
404 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  23.11 
 
 
441 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  27.04 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  27.04 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 
442 aa  76.6  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  27.04 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  29.31 
 
 
1816 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  25.98 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.81 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  22.17 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.96 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  25.87 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  23.2 
 
 
415 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  19.59 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  23.32 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  19.33 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  19.33 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  20.1 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  20.1 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  19.85 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  20.76 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  22.4 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  23.87 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  26.09 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  19.59 
 
 
434 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  21.67 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  23.93 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  22.92 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.16 
 
 
1876 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  20.86 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  27.61 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2100  major facilitator transporter  23.97 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
448 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
440 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 
429 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 
414 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1033  hypothetical protein  25.16 
 
 
273 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  22.78 
 
 
499 aa  66.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0127  macrolide-efflux protein  23.63 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  25.33 
 
 
449 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>