28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2972 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 
273 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  33.46 
 
 
269 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  31.92 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  31.85 
 
 
381 aa  116  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  30.55 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  29.53 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  29.84 
 
 
286 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  30 
 
 
290 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  26.91 
 
 
265 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  28.36 
 
 
269 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  27.78 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.99 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.43 
 
 
271 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  26.62 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  27.13 
 
 
286 aa  87  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  32.43 
 
 
262 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  28.57 
 
 
333 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1865  CRISPR-associated Cas5e family protein  25.47 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  30.2 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.74 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  28.73 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2455  hypothetical protein  21.43 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00191324  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  28.1 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0972  CRISPR-associated RAMP superfamily protein  27.12 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000560395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  22.18 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12838  hypothetical protein  26.4 
 
 
314 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0652997  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0125  CRISPR-associated Cas5e family protein  21.48 
 
 
285 aa  46.2  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>