13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0125 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0125  CRISPR-associated Cas5e family protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1865  CRISPR-associated Cas5e family protein  48.92 
 
 		 285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  40.22 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  41.01 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  26.49 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  27.64 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  24.73 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  21.28 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  22.61 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  22.26 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  21.48 
 
 		 273 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  22.52 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  22.26 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>