20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3572 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  41.01 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1865  CRISPR-associated Cas5e family protein  39.57 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0125  CRISPR-associated Cas5e family protein  41.01 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  24.82 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.47 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  26.2 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  28.1 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  25.81 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.4 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0972  CRISPR-associated RAMP superfamily protein  26.96 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000560395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  23.79 
 
 		 272 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  21.98 
 
 		 265 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  23.78 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  22.9 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  25.74 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  26.67 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  25.93 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  22.74 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  22.96 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>