26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1716 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  100 
 
 
271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  61.11 
 
 
269 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  60.37 
 
 
269 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  50.96 
 
 
272 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  48.83 
 
 
333 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  33.21 
 
 
274 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  33.7 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  31.77 
 
 
287 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  29.43 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  26.97 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  30.77 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  29.3 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  28.78 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.93 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  29.7 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  26.64 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  30.8 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  31.58 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4233  CRISPR-associated Cas5e family protein  47.76 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.500518  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  26.32 
 
 
378 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  33.06 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1865  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.65 
 
 
285 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  24.4 
 
 
288 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12838  hypothetical protein  27.94 
 
 
314 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0652997  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0261  hypothetical protein  27.13 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  20.74 
 
 
325 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>