17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12838 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12838  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  637    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0652997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  30.7 
 
 		 249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0972  CRISPR-associated RAMP superfamily protein  30.83 
 
 		 243 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000560395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2455  hypothetical protein  27.24 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00191324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  21.37 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  26.4 
 
 		 273 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  25.78 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  28.76 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  29.1 
 
 		 241 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  30.14 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  28.1 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.94 
 
 		 271 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0356  CRISPR-associated Cas family protein  33.9 
 
 		 246 aa  46.2  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.299565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  26.83 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  29.01 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0159  CRISPR-associated Cas family protein  30.17 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  31.16 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.583532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>