21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1751 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  520  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12838  hypothetical protein  30.7 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0652997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0972  CRISPR-associated RAMP superfamily protein  29.73 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000560395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2455  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00191324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  29.71 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  24.55 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  24.41 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  28.21 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.06 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  30.53 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.33 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  30.33 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  22.18 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  25 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  28.8 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.42 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  22.22 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  25.95 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  22.93 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  29.55 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.09 
 
 		 325 aa  42.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>