24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2460 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 
272 aa  554  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  52.67 
 
 
269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  51.91 
 
 
269 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  50.96 
 
 
271 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  38.65 
 
 
333 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  29.3 
 
 
274 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  30.71 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  30.04 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  26.62 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  27.84 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  26.79 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  28.52 
 
 
286 aa  82  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.61 
 
 
290 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  34.08 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  29.96 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  32.59 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  27.56 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  23.78 
 
 
381 aa  63.9  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  25.59 
 
 
378 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1865  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.22 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4233  CRISPR-associated Cas5e family protein  38.16 
 
 
78 aa  57  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.500518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  30.27 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  23.79 
 
 
288 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  22.22 
 
 
249 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>