25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1983 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  570  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  53.73 
 
 
269 aa  308  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  57.3 
 
 
286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  30.31 
 
 
273 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.34 
 
 
269 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  30.34 
 
 
269 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  32.1 
 
 
271 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  30.04 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  33.12 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  30.52 
 
 
274 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  28.83 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  27.78 
 
 
275 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  27.97 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  33.55 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.6 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  23.91 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  20.28 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  26.88 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  23.9 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0125  CRISPR-associated Cas5e family protein  25.45 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  39.06 
 
 
241 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.33 
 
 
325 aa  56.2  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  28.73 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12838  hypothetical protein  31.39 
 
 
314 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0652997  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  29.55 
 
 
249 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>