17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1562 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  100 
 
 		 325 aa  672    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1865  CRISPR-associated Cas5e family protein  43.01 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0125  CRISPR-associated Cas5e family protein  40.22 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  41.01 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  26.06 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  27.74 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  23.59 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  18.94 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  26.37 
 
 		 267 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  23.67 
 
 		 287 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  22.91 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  22.55 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  21.19 
 
 		 274 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  22.45 
 
 		 275 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  27.41 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  23 
 
 		 290 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  26.09 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>