27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1632 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 		 265 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  26.91 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  26.09 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  27.41 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.97 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  26.97 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  27.09 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.97 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  26.79 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  27.07 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0972  CRISPR-associated RAMP superfamily protein  24.28 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000560395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  22.3 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1865  CRISPR-associated Cas5e family protein  22.18 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  28.57 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  29.71 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  23.83 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  22.18 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  20.28 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  21.86 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  24.91 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12838  hypothetical protein  21.37 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0652997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  18.94 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  23.33 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0125  CRISPR-associated Cas5e family protein  21.28 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2455  hypothetical protein  24.52 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00191324  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  21.98 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  22.42 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.268714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>