19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1232 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  29.19 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  24.55 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  28.64 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  39.06 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  38.02 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  30.83 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  31.72 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  30.27 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  27.27 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  23.26 
 
 		 333 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12838  hypothetical protein  29.1 
 
 		 314 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0652997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  27.72 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  24.76 
 
 		 274 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  24.35 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  26.67 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  27.91 
 
 		 378 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  22.42 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  22.28 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>