19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3513 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  525  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  33.21 
 
 
274 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  27.56 
 
 
275 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  28.57 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.7 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  28.16 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  31.54 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  25.93 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  28.51 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  27.56 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  26.62 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  28.73 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  24.58 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  28.08 
 
 
286 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  31.72 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  24.13 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  28.24 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  25 
 
 
381 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  31.72 
 
 
378 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>