26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4561 on replicon NC_013160
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 
275 aa  573  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  63.19 
 
 
290 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  59.41 
 
 
286 aa  355  5.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  33.21 
 
 
274 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  31.92 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  30.71 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  27.56 
 
 
268 aa  95.5  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  26.09 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  29.6 
 
 
378 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  28.57 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  27.68 
 
 
286 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  30.04 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.3 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  30.04 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  27.21 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  27.07 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  27.51 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  26.15 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  26.54 
 
 
381 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  27.72 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  22.45 
 
 
325 aa  49.7  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2455  hypothetical protein  22.26 
 
 
244 aa  47  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00191324  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1865  CRISPR-associated Cas5e family protein  23.96 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  22.93 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  22.96 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0972  CRISPR-associated RAMP superfamily protein  25.2 
 
 
243 aa  42.7  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000560395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>