20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0162 on replicon NC_011885
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 
378 aa  775    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  56.37 
 
 
381 aa  415  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  30.55 
 
 
273 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  29.6 
 
 
275 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  27.09 
 
 
265 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  38.89 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  28.88 
 
 
290 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  25.18 
 
 
269 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  36 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  27.17 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  27.54 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  28.46 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.32 
 
 
271 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  25.59 
 
 
272 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  23.9 
 
 
287 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.74 
 
 
269 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  26.81 
 
 
333 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  24.39 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  27.91 
 
 
241 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  31.72 
 
 
268 aa  43.1  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>