24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4174 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  100 
 
 
290 aa  600  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  66.08 
 
 
286 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  63.19 
 
 
275 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  29.45 
 
 
274 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  30 
 
 
273 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.96 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  27.61 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  28.86 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  26.37 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  29.96 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  26.87 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  27.66 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.93 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  28.88 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  29.03 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  25.93 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  26.03 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  27.74 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  22.3 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  23.78 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  27.42 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  23 
 
 
325 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0125  CRISPR-associated Cas5e family protein  22.52 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1865  CRISPR-associated Cas5e family protein  24.15 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>