25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0222 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 
262 aa  524  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  80 
 
 
267 aa  413  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  33.12 
 
 
287 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  33.17 
 
 
274 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  30.42 
 
 
286 aa  88.6  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  28.57 
 
 
275 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  32.43 
 
 
273 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.37 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  32.59 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  32.53 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  32.44 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  26.77 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  31.39 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  31.54 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.58 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  36 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  32.96 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  28.64 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  23.33 
 
 
265 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12838  hypothetical protein  25.78 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0652997  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0972  CRISPR-associated RAMP superfamily protein  23.5 
 
 
243 aa  52  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000560395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.41 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  28.8 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  25.93 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>