17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0972 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0972  CRISPR-associated RAMP superfamily protein  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000560395  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12838  hypothetical protein  30.83 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0652997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2455  hypothetical protein  30.53 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00191324  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  29.73 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  24.28 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  26.36 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  27.12 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  23.5 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  26.96 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  21.58 
 
 		 381 aa  45.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  24.81 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  24.48 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2283  CRISPR-associated protein Cas6  23.96 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  23.33 
 
 		 333 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  23.32 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  25.2 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0125  CRISPR-associated Cas5e family protein  23.08 
 
 		 285 aa  42  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>