27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2232 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2232  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 
274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4561  CRISPR-associated protein Cas6  33.21 
 
 
275 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1716  CRISPR-associated Cas5e family protein  33.21 
 
 
271 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0936700000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4174  CRISPR-associated Cas5e family protein  29.45 
 
 
290 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203943 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3635  CRISPR-associated protein Cas6  29.66 
 
 
286 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2460  CRISPR-associated protein Cas6  29.3 
 
 
272 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0506  CRISPR-associated Cas5e family protein  32.06 
 
 
269 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3513  hypothetical protein  33.21 
 
 
268 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0523  hypothetical protein  32.06 
 
 
269 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  hitchhiker  0.0000432485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2972  CRISPR-associated protein Cas6  27.78 
 
 
273 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1632  CRISPR-associated Cas family protein  27.41 
 
 
265 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0222  CRISPR-associated protein Cas6  33.17 
 
 
262 aa  89  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1983  hypothetical protein  29.72 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.583532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2482  hypothetical protein  28.73 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0706  CRISPR-associated protein Cas6  30.67 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.10742  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0513  hypothetical protein  30.77 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3450  CRISPR-associated protein Cas6  29.84 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.774931  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2381  CRISPR-associated protein Cas6  26.24 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107935  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0162  CRISPR-associated protein Cas6  27.54 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.344037 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1751  hypothetical protein  30.53 
 
 
249 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1562  CRISPR-associated Cas5e family protein  21.19 
 
 
325 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.258656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1232  hypothetical protein  24.76 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.268714 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0972  CRISPR-associated RAMP superfamily protein  24.48 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000560395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1865  CRISPR-associated Cas5e family protein  20.96 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2455  hypothetical protein  20.16 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00191324  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3572  hypothetical protein  22.74 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0125  CRISPR-associated Cas5e family protein  22.26 
 
 
285 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>